Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ALCAMQ13740 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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