Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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