Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZSCAN21-205ENST00000543588 1870 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PHACTR3-205ENST00000395636 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms