Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ITGB3BPQ13352 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGB3BPQ13352 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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