Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM28Q13263 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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