Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms