Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms