Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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TWF1Q12792 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TWF1Q12792 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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