Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRP1Q07954 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms