Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
DEFA6Q01524 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms