Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK17Q00537 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms