Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms