Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P62684 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms