Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EMP3P54852 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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EMP3P54852 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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EMP3P54852 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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EMP3P54852 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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EMP3P54852 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EMP3P54852 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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EMP3P54852 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EMP3P54852 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EMP3P54852 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 IL6-201ENST00000258743 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EMP3P54852 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EMP3P54852 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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EMP3P54852 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EMP3P54852 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EMP3P54852 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EMP3P54852 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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