Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC5A3P53794 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms