Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP4P49662 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP4P49662 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASP4P49662 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP4P49662 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP4P49662 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP4P49662 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP4P49662 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP4P49662 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CASP4P49662 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms