Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms