Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL4AP40617 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms