Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFBP38117 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFBP38117 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFBP38117 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFBP38117 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFBP38117 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFBP38117 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ETFBP38117 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms