Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OTX2P32243 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OTX2P32243 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OTX2P32243 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OTX2P32243 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OTX2P32243 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OTX2P32243 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OTX2P32243 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OTX2P32243 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OTX2P32243 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OTX2P32243 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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OTX2P32243 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OTX2P32243 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OTX2P32243 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OTX2P32243 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OTX2P32243 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OTX2P32243 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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