Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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