Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HRCP23327 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HRCP23327 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HRCP23327 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HRCP23327 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HRCP23327 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HRCP23327 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms