Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms