Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF1P22415 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
USF1P22415 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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