Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDSP20132 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDSP20132 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDSP20132 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDSP20132 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDSP20132 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDSP20132 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SDSP20132 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDSP20132 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDSP20132 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDSP20132 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDSP20132 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDSP20132 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDSP20132 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDSP20132 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms