Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDCP19113 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDCP19113 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDCP19113 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDCP19113 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDCP19113 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDCP19113 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDCP19113 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDCP19113 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDCP19113 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDCP19113 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDCP19113 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDCP19113 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDCP19113 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDCP19113 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms