Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF7P17544 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF7P17544 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF7P17544 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF7P17544 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF7P17544 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF7P17544 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATF7P17544 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATF7P17544 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATF7P17544 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms