Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJA1P17302 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms