Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms