Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VPREB1P12018 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms