Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
APELAP0DMC3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms