Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC175P0C221 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms