Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRCP08575 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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