Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPBP07199 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPBP07199 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPBP07199 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms