Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F13BP05160 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F13BP05160 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
F13BP05160 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F13BP05160 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F13BP05160 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F13BP05160 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
F13BP05160 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
F13BP05160 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
F13BP05160 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
F13BP05160 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms