Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DQB1P01920 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms