Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC24AO95486 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms