Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG7O95352 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG7O95352 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG7O95352 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG7O95352 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG7O95352 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG7O95352 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATG7O95352 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATG7O95352 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms