Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX3O95343 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX3O95343 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX3O95343 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX3O95343 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SIX3O95343 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX3O95343 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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