Protein–RNA interactions for Protein: O94850

DDN, Dendrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDNO94850 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDNO94850 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDNO94850 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DDNO94850 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDNO94850 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDNO94850 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDNO94850 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDNO94850 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDNO94850 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDNO94850 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DDNO94850 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms