Protein–RNA interactions for Protein: O75368

SH3BGRL, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRLO75368 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SH3BGRLO75368 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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SH3BGRLO75368 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SH3BGRLO75368 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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