Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP2O75323 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms