Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLR5O60602 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLR5O60602 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLR5O60602 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms