Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MSI1O43347 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSI1O43347 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSI1O43347 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSI1O43347 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSI1O43347 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSI1O43347 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSI1O43347 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSI1O43347 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MSI1O43347 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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MSI1O43347 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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MSI1O43347 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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MSI1O43347 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSI1O43347 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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