Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LRRTM2O43300 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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