Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QRK9 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QRK9 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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