Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms