Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM3A6NNA2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms