Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms