Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID3CA6NKF2 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms